Η διαδικασία της κλήρωσης για τη League Phase του Κόνφερενς Λιγκ της σεζόν 2026-2027, πραγματοποιήθηκε στο Μονακό, με τον Παναθηναϊκό να μαθαίνει τους έξι αντιπάλους του.
Οι 36 συμμετέχουσες ομάδες είχαν κατανεμηθεί σε έξι γκρουπ δυναμικότητας, με το αυτοματοποιημένο λογισμικό της UEFA να κληρώνει έναν αντίπαλο από κάθε pot, καθορίζοντας έξι αναμετρήσεις (τρεις εντός και τρεις εκτός έδρας).
Οι «πράσινοι» αποφύγαν αρκετές δύσκολες ομάδες, αλλά θα έχουν ορισμένες απαιτητικές αποστολές. Ο Παναθηναϊκός θα υποδεχθεί στο ΟΑΚΑ την αγγλική Μπράιτον, την Μπόρατς και την ΤΣΣΚΑ Σόφιας, ενώ εκτός έδρας θα ταξιδέψει στη Γερμανία για να αντιμετωπίσει τη Φράιμπουργκ, στο Καζακστάν για να παίξει με την Καϊράτ Αλμάτι και στη Δανία για να κοντραριστεί με τη Νόρτζελαντ.
